RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	HYKK	A2RU49	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	PLOD2	O00469	737 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	EML2	O95834	649 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	WDPCP	O95876	746 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	CGA	P01215	116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	NR2F1	P10589	423 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	GABRA5	P31644	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	CDH11	P55287	796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	PPIL2	Q13356	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	P2RY6	Q15077	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	BPTF	Q12830	3046 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	DNM1L	O00429	736 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	BCL10	O95999	233 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	NNMT	P40261	264 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	WNT5A	P41221	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	PDX1	P52945	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	GPR17	Q13304	367 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	VGLL4	Q14135	290 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	KCTD2	Q14681	263 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	FCN2	Q15485	313 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	OLFM1	Q99784	485 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	PSME4	Q14997	1843 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	DMD	P11532	3685 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RPL21-208	ENST00000483765	ADAM20	O43506	726 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	EDN1	P05305	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	DANCR	P0C864	163 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	CEACAM1	P13688	526 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	CA4	P22748	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	SLC9A3	P48764	834 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL21-208	ENST00000483765	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75

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