RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
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SRRT-210ENST00000477529 ERV3-1Q14264 604 aa13.46□□□□□ -0.25
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SRRT-210ENST00000477529 TSNQ15631 228 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
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SRRT-210ENST00000477529 GRTP1Q5TC63 336 aa13.46□□□□□ -0.25
SRRT-210ENST00000477529 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
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SRRT-210ENST00000477529 OR56A3Q8NH54 315 aa13.46□□□□□ -0.25
SRRT-210ENST00000477529 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa13.46□□□□□ -0.25
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SRRT-210ENST00000477529 OR4K3Q96R72 315 aa13.46□□□□□ -0.25
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SRRT-210ENST00000477529 ACSS3Q9H6R3 686 aa13.46□□□□□ -0.25
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SRRT-210ENST00000477529 CDC14CA4D256 554 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 C9J4A7 227 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 H7BY64 318 aa13.45□□□□□ -0.26
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SRRT-210ENST00000477529 P2RX6O15547 441 aa13.45□□□□□ -0.26
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SRRT-210ENST00000477529 C1QL1O75973 258 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 RECKO95980 971 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 PRB1P04280 392 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 FAM87AP0C7U9 286 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CCDC166P0CW27 439 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CD1DP15813 335 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 AGXTP21549 392 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 PHBP35232 272 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CSRP3P50461 194 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ARSFP54793 590 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CDKL1Q00532 357 aa13.45□□□□□ -0.26
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SRRT-210ENST00000477529 SLC9A5Q14940 896 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 UGT8Q16880 541 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 PRTGQ2VWP7 1150 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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SRRT-210ENST00000477529 UBXN10Q96LJ8 280 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 C10orf90Q96M02 699 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 PRAP1Q96NZ9 151 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.45□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TMEM184CQ9NVA4 438 aa13.45□□□□□ -0.26
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SRRT-210ENST00000477529 RHOXF2BP0C7M4 288 aa13.44□□□□□ -0.26
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SRRT-210ENST00000477529 FOXL2P58012 376 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CSNK1G2P78368 415 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 DCDP81605 110 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
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SRRT-210ENST00000477529 HKDC1Q2TB90 917 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TMEM151BQ8IW70 566 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 SPATA6LQ8N4H0 392 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 EXD3Q8N9H8 876 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ATL1Q8WXF7 558 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CYTH2Q99418 400 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 RHOXF2Q9BQY4 288 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 DHRS4Q9BTZ2 278 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 NDOR1Q9UHB4 597 aa13.44□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 POLHQ9Y253 713 aa13.44□□□□□ -0.26
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