RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 SSPNQ14714 243 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 C17orf64Q86WR6 236 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 RELL1Q8IUW5 271 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PLD3Q8IV08 490 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ATL1Q8WXF7 558 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 OR4K3Q96R72 315 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 HAUS8Q9BT25 410 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 OARD1Q9Y530 152 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.74□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 FEZF1A0PJY2 475 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ARGFXA6NJG6 315 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 TXNDC9O14530 226 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ALBP02768 609 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CCDC166P0CW27 439 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CDH1P12830 882 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CD1DP15813 335 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ECHS1P30084 290 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PHBP35232 272 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 FOLR3P41439 243 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 EMP3P54852 163 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 FOXL2P58012 376 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 RAB10P61026 200 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CDKL1Q00532 357 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 NFATC3Q12968 1075 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 NAB1Q13506 487 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 NKG7Q16617 165 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 MUM1Q2TAK8 710 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 HKDC1Q2TB90 917 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 COX15Q7KZN9 410 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 COL26A1Q96A83 441 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PTERQ96BW5 349 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CABS1Q96KC9 395 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 C10orf90Q96M02 699 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 EGFL8Q99944 293 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 DERL2Q9GZP9 239 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.73□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 B8ZZF3 427 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 P2RX6O15547 441 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 DNAJB5O75953 348 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 UMODP07911 640 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 OTX2P32243 289 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 GRK3P35626 688 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 GMPRP36959 345 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 HNMTP50135 292 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CCL11P51671 97 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 PMS2P54278 862 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V0D1P61421 351 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CHAF1BQ13112 559 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CSHL1Q14406 222 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 TGFBIQ15582 683 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 RAPH1Q70E73 1250 aa8.72□□□□□ -1.01
SYN3-211ENST00000472027 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.72□□□□□ -1.01
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