RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465721.1

CNOT4-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, human

TSL 4

Gene CNOT4, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT4-208	ENST00000465721	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	DPH7	Q9BTV6	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CNOT4-208	ENST00000465721	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	P2RX6	O15547	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PSMD3	O43242	534 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PHF2	O75151	1096 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	VPS26A	O75436	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SUN1	O94901	812 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ICAM2	P13598	275 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	CMPK1	P30085	196 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	CCNF	P41002	786 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	GRIA1	P42261	906 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	RWDD2B	P57060	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TLE4	Q04727	773 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SIAH3	Q8IW03	269 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	CEP97	Q8IW35	865 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	FRMD6	Q96NE9	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	DRC3	Q9H069	523 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ADAM10	O14672	748 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ANXA5	P08758	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	NUDT7	P0C024	238 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PRAME	P78395	509 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	GBX1	Q14549	363 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNF425	Q6IV72	752 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PEX13	Q92968	403 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	NPAS2	Q99743	824 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	TTI1	O43156	1089 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	MATN4	O95460	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	CYC1	P08574	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CNOT4-208	ENST00000465721	MYBL2	P10244	700 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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