RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 INTUQ9ULD6 942 aa13.5□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 KRT87PA6NCN2 255 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MROH6A6NGR9 719 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 E9PLN8 166 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 I3L1I5 382 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PSMD3O43242 534 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SLCO2B1O94956 709 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 METTL18O95568 372 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 CD96P40200 585 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 COPS2P61201 443 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PRAMEP78395 509 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 HSF1Q00613 529 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TUBA3CQ13748 450 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TRIM14Q14142 442 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MAPKAPK3Q16644 382 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 HKDC1Q2TB90 917 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 KCTD11Q693B1 232 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 AFTPHQ6ULP2 937 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TMEM205Q6UW68 189 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 DOLPP1Q86YN1 238 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 AMER3Q8N944 861 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 FAM71DQ8N9W8 422 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 DRC3Q9H069 523 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 NFS1Q9Y697 457 aa13.49□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SUN1O94901 812 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 C1orf105O95561 183 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 AOAHP28039 575 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SLC26A3P40879 764 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MAGEA1P43355 309 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 AVPR1BP47901 424 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 EMP3P54852 163 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 YBX1P67809 324 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TCEAL1Q15170 157 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MEP1AQ16819 746 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 P3H1Q32P28 736 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 CCSMST1Q4G0I0 132 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 GARNL3Q5VVW2 1013 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 LINC00523Q86TU6 105 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MMP21Q8N119 569 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 OR4L1Q8NH43 312 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MAGEC3Q8TD91 643 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ZNF559Q9BR84 538 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TGIF2Q9GZN2 237 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ABHD10Q9NUJ1 306 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ABCF3Q9NUQ8 709 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.48□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 OR2A25A4D2G3 310 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 FOXO6A8MYZ6 492 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TXNDC9O14530 226 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PJA2O43164 708 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 TJP3O95049 919 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 CCNFP41002 786 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PPP2R2AP63151 447 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 NDUFA9Q16795 377 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PLAG1Q6DJT9 500 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SUSD1Q6UWL2 747 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 LANCL3Q6ZV70 420 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 OTOAQ7RTW8 1153 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ADCK2Q7Z695 626 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 PANX3Q96QZ0 392 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 CYTH2Q99418 400 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 VN1R1Q9GZP7 353 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.47□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.46□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 SCN2AQ99250 2005 aa13.46□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 A0A1W2PPV9 198 aa13.46□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 ASPDHA6ND91 283 aa13.46□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.46□□□□□ -0.25
CENPF-202ENST00000464322 GABRR3A8MPY1 467 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms