RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 FRMD1Q8N878 549 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 STMN2Q93045 179 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 APOLD1Q96LR9 279 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ZBTB18Q99592 522 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 PSMG1O95456 288 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 SLC6A2P23975 617 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 C21orf58P58505 322 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 LAYNQ6UX15 382 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 RLN3Q8WXF3 142 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TESCQ96BS2 214 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ASB9Q96DX5 294 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TMEM74Q96NL1 305 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ADA2Q9NZK5 511 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ICKQ9UPZ9 632 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ACOT8O14734 319 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SCAMP1O15126 338 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KDM1AO60341 852 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PRMT3O60678 531 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PGRP06401 933 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PCNAP12004 261 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TACR1P25103 407 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ACTR1BP42025 376 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ACTR1AP61163 376 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.63□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 AAGABQ6PD74 315 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NRROSQ86YC3 692 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KRT78Q8N1N4 520 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PJA1Q8NG27 643 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 RHBGQ9H310 441 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.63□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 KRT36O76013 467 aa14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 F3P13726 295 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CXCR2P25025 360 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC7A2P52569 658 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MS4A2Q01362 244 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KRT33BQ14525 404 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 HID1Q8IV36 788 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 RNF148Q8N7C7 305 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.62□□□□□ -0.07
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