RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422143.2

TRBV29-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 29-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV29-1, Length 402 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV29-1-201ENST00000422143 FOXB1Q99853 325 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 NAT9Q9BTE0 207 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 RAB17Q9H0T7 212 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 RDH14Q9HBH5 336 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.06□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SCN8AQ9UQD0 1980 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 KLHL33A6NCF5 533 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 FAM159BA6NKW6 160 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 OR5K4A6NMS3 321 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 NUDT19A8MXV4 375 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 BTN3A3O00478 584 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 FAM155BO75949 473 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TSPAN12O95859 305 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 FTH1P02794 183 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 OR56A5P0C7T3 313 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 MTHFD2P13995 350 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TYRP1P17643 537 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ENPP1P22413 925 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 GFERP55789 205 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SCAND1P57086 179 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PPP1CAP62136 330 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SHC2P98077 582 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 E2F1Q01094 437 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CAV1Q03135 178 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 MGAT5Q09328 741 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ABRQ12979 859 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 RPA4Q13156 261 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PRKG2Q13237 762 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CUL1Q13616 776 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PDCD1Q15116 288 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ISXQ2M1V0 245 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CYS1Q717R9 158 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CBLL1Q75N03 491 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SLC9B2Q86UD5 537 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PIM3Q86V86 326 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CCDC25Q86WR0 208 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 LRRC6Q86X45 466 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SLC22A15Q8IZD6 547 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 HIPK4Q8NE63 616 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 GSDMBQ8TAX9 411 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CD200R1Q8TD46 325 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CALML6Q8TD86 181 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ELMO1Q92556 727 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 RSC1A1Q92681 617 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 C12orf66Q96MD2 445 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 SLC38A3Q99624 504 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 OLFM1Q99784 485 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 XKR8Q9H6D3 395 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 UCK1Q9HA47 277 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 FAM114A2Q9NRY5 505 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 POT1Q9NUX5 634 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 PDP2Q9P2J9 529 aa5.05□□□□□ -1.6
TRBV29-1-201ENST00000422143 CIDEBQ9UHD4 219 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms