RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SMPDL3AQ92484 453 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 HAUS8Q9BT25 410 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 TAC3Q9UHF0 121 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 A6NCN8 305 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ZNF217O75362 1048 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SDC1P18827 310 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PKLRP30613 574 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RABIFP47224 123 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ZXDAP98168 799 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MTAPQ13126 283 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 NRROSQ86YC3 692 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RNF148Q8N7C7 305 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ZNF740Q8NDX6 193 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 APOLD1Q96LR9 279 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 XKR8Q9H6D3 395 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PCNAP12004 261 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ATP6V1C1P21283 382 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PSMB5P28074 263 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RAB28P51157 221 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 DGKQP52824 942 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 TCEA2Q15560 299 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CLMPQ9H6B4 373 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SPAG4Q9NPE6 437 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CD300AQ9UGN4 299 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ICKQ9UPZ9 632 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 A0A1W2PPC4 97 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 DYTNA2CJ06 578 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ZNF839A8K0R7 811 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 BAG2O95816 211 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PRPS2P11908 318 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ACADSP16219 412 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MS4A2Q01362 244 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 LRRC58Q96CX6 371 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 MAP3K7O43318 606 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RASGRP1O95267 797 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SLC6A2P23975 617 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CLDN8P56748 225 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 C17orf64Q86WR6 236 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 DPP10Q8N608 796 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 REPS1Q96D71 796 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 EGLN2Q96KS0 407 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 TMEM74Q96NL1 305 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 DPY30Q9C005 99 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ADA2Q9NZK5 511 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 KLF15Q9UIH9 416 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ME2P23368 584 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ACTR1BP42025 376 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SLC7A2P52569 658 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 ACTR1AP61163 376 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 LAPTM5Q13571 262 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GPC1-202ENST00000420138 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms