RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TSPEARQ8WU66 669 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 EGLN2Q96KS0 407 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 A0A096LPI6 279 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 M0R129 80 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CXCR6O00574 342 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GABARAPO95166 117 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PRR35P0CG20 571 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CD70P32970 193 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SPAM1P38567 509 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 DGKEP52429 567 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GPNMBQ14956 572 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 NDUFA5Q16718 116 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 LRRC66Q68CR7 880 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GPR26Q8NDV2 337 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF583Q96ND8 569 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 DEFB118Q96PH6 123 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 OR2AG2A6NM03 316 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SLC22A1O15245 554 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 RGS5O15539 181 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CLDN9O95484 217 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SERPINA1P01009 418 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CD6P30203 668 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CASP9P55211 416 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 AP1S1P61966 158 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZXDBP98169 803 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GRIK2Q13002 908 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 MED8Q96G25 268 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 P2RY12Q9H244 342 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 A0A1W2PRU2 124 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 NTRK1P04629 796 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 COL6A1P12109 1028 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 OR2B6P58173 313 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ABRQ12979 859 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 19.4
ATG4B-206ENST00000405546 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SUN5Q8TC36 379 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 BTBD2Q9BX70 525 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 VNN3Q9NY84 501 aa14.58□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLC28A1O00337 649 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MANBAO00462 879 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KLK8O60259 260 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 BCKDHAP12694 445 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LMAN2Q12907 356 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZFP69Q49AA0 526 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 C1orf109Q9NX04 203 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DKK3Q9UBP4 350 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PRELID1Q9Y255 219 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PTPRDP23468 1912 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PDYNP01213 254 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 C1QCP02747 245 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GADD45AP24522 165 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ACRV1P26436 265 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LIPAP38571 399 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LHX8Q68G74 356 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CES5AQ6NT32 575 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GTF2H4Q92759 462 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SCAMP4Q969E2 229 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TXNDC15Q96J42 360 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 INPP5KQ9BT40 448 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MUC13Q9H3R2 512 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 AIREO43918 545 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ITIH1P19827 911 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TACR1P25103 407 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 AQP1P29972 269 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms