RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391247.1

RNA5SP354-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 354, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP354, Length 136 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP354-201ENST00000391247 NDUFB10O96000 172 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 MT-ND1P03886 318 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 HMBSP08397 361 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SLC2A3P11169 496 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 RALBP11234 206 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 CEBPBP17676 345 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 CD58P19256 250 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ATP6V1C1P21283 382 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 BMP5P22003 454 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 PRKACBP22694 351 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 FPR3P25089 353 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 DCTDP32321 178 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 OR1D2P34982 312 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 CA8P35219 290 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 MAGEA1P43355 309 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TNFRSF4P43489 277 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SLC6A8P48029 635 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 GLIPR1P48060 266 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SLC1A6P48664 564 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SLC11A1P49279 550 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 COPB1P53618 953 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 MAPK12P53778 367 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 CTAG1AP78358 180 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ABATP80404 500 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 CBX1P83916 185 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SLC20A2Q08357 652 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TROAPQ12815 778 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 FOXL1Q12952 345 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TRDNQ13061 729 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ITGADQ13349 1161 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ENPP2Q13822 863 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SELPLGQ14242 412 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 NPTX1Q15818 432 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TATDN3Q17R31 274 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ZSWIM7Q19AV6 140 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 LRIT3Q3SXY7 679 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 POM121L1PQ3SYA9 428 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 USH1GQ495M9 461 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SPDYE7PQ495Y7 208 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 LDLRAP1Q5SW96 308 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 AKNAD1Q5T1N1 836 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 NT5DC1Q5TFE4 455 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 FRG2Q64ET8 278 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 PMF1Q6P1K2 205 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 KLC3Q6P597 504 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SLC39A4Q6P5W5 647 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 DHRS13Q6UX07 377 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 G2E3Q7L622 706 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 GPR141Q7Z602 305 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 FAM228AQ86W67 206 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 FAM131BQ86XD5 332 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 C1orf210Q8IVY1 113 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 BMPERQ8N8U9 685 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SCCPDHQ8NBX0 429 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 OR9A1PQ8NGU1 263 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 LIPHQ8WWY8 451 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SUSD6Q92537 303 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 GGHQ92820 318 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 OSTF1Q92882 214 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 WBP2Q969T9 261 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TMIGD2Q96BF3 282 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 COQ2Q96H96 371 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 C4orf36Q96KX1 117 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 C7orf34Q96L11 122 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 GPR137Q96N19 417 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ZNF570Q96NI8 536 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TUBA1CQ9BQE3 449 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 LZTS2Q9BRK4 669 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 CBWD1Q9BRT8 395 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ALG12Q9BV10 488 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 GON7Q9BXV9 100 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 KLC2Q9H0B6 622 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 MED20Q9H944 212 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 Q9N2K0 584 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 GPR108Q9NPR9 543 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 QPCTLQ9NXS2 382 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 KLHL28Q9NXS3 571 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 DONSONQ9NYP3 566 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 SPATA7Q9P0W8 599 aa2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNA5SP354-201ENST00000391247 RHCGQ9UBD6 479 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms