RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298317.8

RPUSD4-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-201ENST00000298317 ASAH1Q13510 395 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 EFR3AQ14156 821 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ALFQ53S48 1182 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 OR4F3Q6IEY1 312 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 GPR151Q8TDV0 419 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 SNAPC3Q92966 411 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 RNF31Q96EP0 1072 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ZFP42Q96MM3 310 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC22A4Q9H015 551 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 C12orf71A8MTZ7 269 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PDHXO00330 501 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 GFRA2O00451 464 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 OR1I1O60431 355 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNJ13O60928 360 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ARHGEF15O94989 841 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ITGB1P05556 798 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 HSMCR30P0CW71 290 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 CYP4F2P78329 520 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TP53BP2Q13625 1128 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 DOK6Q6PKX4 331 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 SBSNQ6UWP8 590 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 CBLL1Q75N03 491 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 GALNT10Q86SR1 603 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PLCZ1Q86YW0 608 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM181AQ8N9Y4 354 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 OR4K2Q8NGD2 314 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNJ9Q92806 393 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TRIB3Q96RU7 358 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ZYG11BQ9C0D3 744 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 DOCK4Q8N1I0 1966 aa13.1□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 SHOXO15266 292 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 B3GALT4O96024 378 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ESR1P03372 595 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 GSTM1P09488 218 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 BCKDHAP12694 445 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PSMA3P25788 255 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PCSK1P29120 753 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 KDELR2P33947 212 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PIK3CGP48736 1102 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 CD83Q01151 205 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 IL10RBQ08334 325 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ST3GAL4Q11206 333 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 VMACQ2NL98 169 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ANKRD46Q86W74 232 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ZZZ3Q8IYH5 903 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PIANPQ8IYJ0 282 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 RGL4Q8IZJ4 473 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 DTX3Q8N9I9 347 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 BEX2Q9BXY8 128 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 BARHL1Q9BZE3 327 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 ZNF226Q9NYT6 803 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 SNX7Q9UNH6 387 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PATJQ8NI35 1801 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PCNTO95613 3336 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 B4DXG7 233 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 FFAR3O14843 346 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 GPR42O15529 346 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 GPX5O75715 221 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 WDR47O94967 919 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 S100A3P33764 101 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 NKX3-2P78367 333 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TNK1Q13470 666 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 VGLL4Q14135 290 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TSTQ16762 297 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TIGD3Q6B0B8 471 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM171BQ6P995 826 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM124AQ86V42 546 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 C3orf58Q8NDZ4 430 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 COQ8BQ96D53 544 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 OR5M11Q96RB7 305 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 TAS2R16Q9NYV7 291 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 RWDD3Q9Y3V2 267 aa13.09□□□□□ -0.31
RPUSD4-201ENST00000298317 A0A1W2PQ72 361 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC182A6NF36 153 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 EFCAB10A6NFE3 127 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 MOXD2PA6NHM9 499 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 HAS3O00219 553 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 MYL9P24844 172 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 CLDN8P56748 225 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 RPS14P62263 151 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 PSPHP78330 225 aa13.08□□□□□ -0.32
RPUSD4-201ENST00000298317 SCN1BQ07699 218 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms