RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MYLK3Q32MK0 819 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF613Q6PF04 617 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB7O75027 752 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR1BP42025 376 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR1AP61163 376 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SCRN3Q0VDG4 424 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PTCHD3Q3KNS1 767 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR2L5Q8NG80 312 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 LMO3Q8TAP4 145 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SEC14L1Q92503 715 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PSAT1Q9Y617 370 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN7O95471 211 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DPB1P04440 258 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ACP5P13686 325 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TGFBIQ15582 683 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD13Q7L211 337 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM74Q96NL1 305 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM165Q9HC07 324 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JN53 185 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD6O75354 484 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 BCHEP06276 602 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 DBIP07108 87 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 LRCH3Q96II8 777 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TSGA13Q96PP4 275 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MKLN1Q9UL63 735 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF676Q8N7Q3 588 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NR4A3Q92570 626 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KXD1Q9BQD3 176 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RMI1Q9H9A7 625 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MTX2O75431 263 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PGDP52209 483 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PDGFRLQ15198 375 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CEP68Q76N32 757 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD3Q9Y597 815 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CA12O43570 354 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ARL6IP5O75915 188 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ACADVLP49748 655 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ST3GAL3Q11203 375 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GPR17Q13304 367 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PSKH2Q96QS6 385 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 E7ESA3 106 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CHP2O43745 196 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 INHAP05111 366 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 VLDLRP98155 873 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCZQ05513 592 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OLIG2Q13516 323 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT7Q86SF2 657 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PEX13Q92968 403 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TBX5Q99593 518 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CD244Q9BZW8 370 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MKS1Q9NXB0 559 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5AP00167 134 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CCKBRP32239 447 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 IQCF2Q8IXL9 164 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SUN5Q8TC36 379 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC107Q8WV48 283 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PLOD2O00469 737 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms