RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 A0A1W2PPV9 198 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 DYTNA2CJ06 578 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 MAGEB17A8MXT2 336 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CFLARO15519 480 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 MAP3K7O43318 606 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 MGRN1O60291 552 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PDE5AO76074 875 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 MYO1DO94832 1006 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CCNDBP1O95273 360 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 EML2O95834 649 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PRPS2P11908 318 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ACPPP15309 386 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 AMD1P17707 334 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CXCR2P25025 360 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CD38P28907 300 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 RAP1GDS1P52306 607 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ACSM2AQ08AH3 577 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PTGR1Q14914 329 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PLCL1Q15111 1095 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 VPS26BQ4G0F5 336 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 TIGD2Q4W5G0 525 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 COQ5Q5HYK3 327 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ICE2Q659A1 982 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ACSM2BQ68CK6 577 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 HACD2Q6Y1H2 254 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ADCK2Q7Z695 626 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 NRROSQ86YC3 692 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 LAS2Q8IYD9 372 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 LINC01555Q8NAE3 123 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PROKR1Q8TCW9 393 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ROPN1LQ96C74 230 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 APIPQ96GX9 242 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 TEX37Q96LM6 180 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 APOLD1Q96LR9 279 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SERPINI1Q99574 410 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 AIF1LQ9BQI0 150 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 EBPLQ9BY08 206 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 DPY30Q9C005 99 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 RASSF4Q9H2L5 321 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SPNS1Q9H2V7 528 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 DMRT3Q9NQL9 472 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 VPS29Q9UBQ0 182 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 A0A088AWK7 358 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 A0A1W2PP18 115 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 A6NCN8 305 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 K7ESF4 209 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SH3BGRLO75368 114 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ATP6V1G2O95670 118 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 BCKDHAP12694 445 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PCSK2P16519 638 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 BCKDHBP21953 392 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 IL12AP29459 219 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CCR8P51685 355 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PSME3P61289 254 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ZXDAP98168 799 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 REEP5Q00765 189 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 KIAA0040Q15053 153 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SPIN4Q56A73 249 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 LAYNQ6UX15 382 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 LCN9Q8WX39 176 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 VPS33AQ96AX1 596 aa7.99□□□□□ -1.13
COPS4-201ENST00000264389 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms