RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TAP2Q03519 686 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CDC16Q13042 620 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MFAP5Q13361 173 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CTBP1Q13363 440 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF425Q6IV72 752 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00696Q6ZRV3 163 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 LAPTM4BQ86VI4 370 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 KCNMB4Q86W47 210 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CALML6Q8TD86 181 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF480Q8WV37 535 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 ASB11Q8WXH4 323 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 PBKQ96KB5 322 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 OR2A5Q96R48 311 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 DHRS7Q9Y394 339 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 IDSB3KWA1 339 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 SMAPO00193 183 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 KLHL18O94889 574 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC26A3P40879 764 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 HKDC1Q2TB90 917 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TTC27Q6P3X3 843 aa20.03■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 C8orf44Q96CB5 159 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 SERPINB12Q96P63 405 aa20.03■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC30A3Q99726 388 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.03■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 GFYI3L273 518 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 HEXBP07686 556 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 FAM53BQ14153 422 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFA9Q16795 377 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 LONRF1Q17RB8 773 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 ADCK2Q7Z695 626 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 GRHL3Q8TE85 626 aa20.02■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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NEDD8-201ENST00000250495 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD8-201ENST00000250495 NOTCH2Q04721 2471 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 KIF5CO60282 957 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 SERPINA7P05543 415 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 COX6A1P12074 109 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 EDN3P14138 238 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 HRH2P25021 359 aa20.01■□□□□ 0.79
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NEDD8-201ENST00000250495 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.01■□□□□ 0.79
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NEDD8-201ENST00000250495 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 OR1N1Q8NGS0 311 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 MS4A14Q96JA4 679 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 PRAP1Q96NZ9 151 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 SYNPO2LQ9H987 977 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 RIC8BQ9NVN3 520 aa20■□□□□ 0.79
NEDD8-201ENST00000250495 PTGFRNQ9P2B2 879 aa20■□□□□ 0.79
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