RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 POLE4Q9NR33 117 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 CREBZFQ9NS37 354 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM12O43184 909 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 LIPAP38571 399 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 BCL2L1Q07817 233 aa21.46■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 LYSMD2Q8IV50 215 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 C7orf34Q96L11 122 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 TTPALQ9BTX7 342 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.46■■□□□ 1.03
HTATSF1-201ENST00000218364 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN5P54829 565 aa21.45■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.45■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 M0R082 166 aa21.44■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINB1P30740 379 aa21.44■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 CCR7P32248 378 aa21.44■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 OR8J2Q8NGG1 315 aa21.44■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 FRG2BQ96QU4 278 aa21.44■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa21.44■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 HCSTQ9UBK5 93 aa21.44■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 RNF6Q9Y252 685 aa21.44■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ8Q15842 424 aa21.44■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 TM4SF4P48230 202 aa21.43■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 C21orf58P58505 322 aa21.43■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.43■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa21.43■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 NOGQ13253 232 aa21.43■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 GPR26Q8NDV2 337 aa21.43■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC36A6NLP5 189 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ10P78508 379 aa21.42■■□□□ 1.02
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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