RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ACTR1AP61163 376 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF33BQ06732 778 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RAPSNQ13702 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR4C6Q8NH72 309 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ESAMQ96AP7 390 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 DGAT2Q96PD7 388 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 EBF3Q9H4W6 596 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD3Q9Y597 815 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PDCD5O14737 125 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFS4O43181 175 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 S1PR4O95977 384 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GIMD1P0DJR0 217 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IL7RP16871 459 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G16P53816 162 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NRG3P56975 720 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CADM2Q8N3J6 435 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF570Q96NI8 536 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GALPQ9UBC7 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TAC3Q9UHF0 121 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FAM149AA5PLN7 773 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF12O95522 483 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TIMP1P01033 207 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HOXB2P14652 356 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ECHS1P30084 290 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CLCN2P51788 898 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CLCNKAP51800 687 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 POC5Q8NA72 575 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FLCNQ8NFG4 579 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GPR150Q8NGU9 434 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PIK3R3Q92569 461 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RDH12Q96NR8 316 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 IRAK3Q9Y616 596 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 HMGN1P05114 100 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KLK1P06870 262 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GJA1P17302 382 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 UFM1P61960 85 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MVKQ03426 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 FIBINQ8TAL6 211 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 UFD1Q92890 307 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PTPN18Q99952 460 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ACTL8Q9H568 366 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RASSF1Q9NS23 344 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GRID2O43424 1007 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TGFB1P01137 390 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 C9P02748 559 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 CTSAP10619 480 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TFPIP10646 304 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 UQCRC2P22695 453 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEA6P43360 314 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ACADVLP49748 655 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 OLIG2Q13516 323 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 COQ5Q5HYK3 327 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KANK2Q63ZY3 851 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ATG9BQ674R7 924 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GALNT7Q86SF2 657 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 KCNH6Q9H252 994 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 A0A096LPI6 279 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-228ENST00000636120 AREL1O15033 823 aa6.28□□□□□ -1.4
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