RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNFSF14O43557 240 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 HCRTR2O43614 444 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SCO2O43819 266 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACSL3O95573 720 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 GH2P01242 217 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGLV3-19P01714 112 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PIGRP01833 764 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF823P16415 610 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNFRSF4P43489 277 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCR5P51681 352 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SUOXP51687 545 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 LBX1P52954 281 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PFN3P60673 137 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPP2R2BQ00005 443 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSG7Q13046 419 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRKG1Q13976 671 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 MELKQ14680 651 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 C16orf72Q14CZ0 275 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 LY6EQ16553 131 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 GSG1Q2KHT4 349 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 OTPQ5XKR4 325 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM198Q66K66 360 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDC73Q6P1J9 531 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM114A1Q8IWE2 563 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDK20Q8IZL9 346 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGAP24Q8N264 748 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM89BQ8N5H3 189 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF491Q8N8L2 437 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC37A3Q8NCC5 494 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4D10Q8NGI6 311 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5M8Q8NGP6 311 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 NABP1Q96AH0 204 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIF1BPQ96EK5 621 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 APOPT1Q96IL0 206 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPP4Q96JB8 637 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 IMMP1LQ96LU5 166 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TECTBQ96PL2 329 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAP7D2Q96T17 732 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRPV4Q9HBA0 871 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL1RAPQ9NPH3 570 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 NLGN3Q9NZ94 848 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PKD2L2Q9NZM6 624 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PNMA2Q9UL42 364 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 STUB1Q9UNE7 303 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 BRWD3Q6RI45 1802 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SSPOA2VEC9 5147 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SALL1Q9NSC2 1324 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A0U1RQK1 487 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 B4DXG7 233 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 H3BQ06 376 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 E2F3O00716 465 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 FPGTO14772 594 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SURF4O15260 269 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP1A3P13637 1013 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 PKLRP30613 574 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 EFNA3P52797 238 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 IST1P53990 364 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TBX4P57082 545 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 NEXNQ0ZGT2 675 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TGIF1Q15583 401 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAZQ16635 292 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ODF4Q2M2E3 257 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 VWA2Q5GFL6 755 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXO47Q5MNV8 452 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q5W150 140 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 NUDT13Q86X67 352 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 CEP57L1Q8IYX8 460 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPICE1Q8N0Z3 855 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 AFAP1Q8N556 730 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR7A2PQ8NGA2 310 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 MOSPD2Q8NHP6 518 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 MORC4Q8TE76 937 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 C4orf45Q96LM5 186 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR6C1Q96RD1 312 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-90P-201ENST00000606352 DDOQ99489 341 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms