RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588228.5

NFIX-210, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NFIX, Length 1,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-210ENST00000588228 RCN1Q15293 331 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 CCDC6Q16204 474 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 DPP10Q8N608 796 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 UBE2E3Q969T4 207 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 PDXPQ96GD0 296 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 SHDQ96IW2 340 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 EBF2Q9HAK2 575 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 WNT16Q9UBV4 365 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 DMTF1Q9Y222 760 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.96■□□□□ 0.15
NFIX-210ENST00000588228 PIPSLA2A3N6 862 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 KRBA1A5PL33 1030 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 PCNAP12004 261 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 NUDT1P36639 197 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 CLDN8P56748 225 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 FZD5Q13467 585 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 GAS6Q14393 721 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 PAGE3Q5JUK9 113 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 GPR153Q6NV75 609 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 RNF175Q8N4F7 328 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 RNF148Q8N7C7 305 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 APOLD1Q96LR9 279 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 CLMPQ9H6B4 373 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 CD300AQ9UGN4 299 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 ZNF217O75362 1048 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 IL6P05231 212 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SDC1P18827 310 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 CD6P30203 668 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 RABIFP47224 123 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SLC7A2P52569 658 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 AP2B1P63010 937 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 KRT33BQ14525 404 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 RPE65Q16518 533 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 C17orf64Q86WR6 236 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 ASB9Q96DX5 294 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 HHIPQ96QV1 700 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 PELI2Q9HAT8 420 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 TAC3Q9UHF0 121 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.95■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 NUMA1Q14980 2115 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 CDH1P12830 882 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 RAB28P51157 221 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 FLOT2Q14254 428 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SPATS1Q496A3 300 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 Q6ZSR6 202 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 ADHFE1Q8IWW8 467 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 KRT78Q8N1N4 520 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SLC13A3Q8WWT9 602 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SH3KBP1Q96B97 665 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 NELL2Q99435 816 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 S100A14Q9HCY8 104 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.94■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 A0A1W2PPV9 198 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 FAM170BA6NMN3 283 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 ACOT8O14734 319 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SCAMP1O15126 338 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 MAP3K7O43318 606 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 KDM1AO60341 852 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 MYO1DO94832 1006 aa15.93■□□□□ 0.14
NFIX-210ENST00000588228 SLC6A2P23975 617 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms