RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 THEGQ9P2T0 379 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CBLCQ9ULV8 474 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.16□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 DHRS12A0PJE2 317 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 C9orf118A6NHY6 69 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CCDC154A6NI56 674 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 AGAP14A8MT82 685 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC28A1O00337 649 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 NME4O00746 187 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GPR42O15529 346 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FFAR2O15552 330 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RGS14O43566 566 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TULP3O75386 442 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 KATNA1O75449 491 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC22A3O75751 556 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ATP6AP2O75787 350 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 KNG1P01042 644 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 AMY2AP04746 511 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LINC00032P0C843 101 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PRSS56P0CW18 603 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SMIM18P0DKX4 95 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CD1EP15812 388 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TSPAN8P19075 237 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 AMY2BP19961 511 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 JAK1P23458 1154 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC6A2P23975 617 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FASP25445 335 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 NFKBIAP25963 317 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 HMOX2P30519 316 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GRIA3P42263 894 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 NSG1P42857 185 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 HK3P52790 923 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 EPHA5P54756 1037 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 EMX2Q04743 252 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZNF33BQ06732 778 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RALGDSQ12967 914 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SP140Q13342 867 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GTF2H2Q13888 395 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 NFYCQ13952 458 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GRB7Q14451 532 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ICAM4Q14773 271 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 BORAQ6PGQ7 559 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SBSNQ6UWP8 590 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 USP45Q70EL2 814 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ELMOD1Q8N336 334 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZBTB2Q8N680 514 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 RNF148Q8N7C7 305 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 LEMD2Q8NC56 503 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 FIBINQ8TAL6 211 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SCLYQ96I15 445 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 KCNA7Q96RP8 456 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 ZBTB18Q99592 522 aa6.15□□□□□ -1.42
CLTC-211ENST00000579815 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms