RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQCKQ8N0W5 287 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC22Q8N4W6 341 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM79Q9BSE2 394 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXJ2Q9P0K8 574 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 XPR1Q9UBH6 696 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX7Q9UNH6 387 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAPBPO15533 448 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPNS1P04632 268 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSTA1P08263 222 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM150CB9EJG8 249 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP2K7O14733 419 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2D5Q6ZV89 423 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCRL4Q96PJ5 515 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM184CQ9NVA4 438 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCDC2Q9UHG0 476 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSL6Q9UKU0 697 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLCL2Q9UPR0 1127 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2B3Q9UQQ2 575 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXO6A8MYZ6 492 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR47O94967 919 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 GDF5P43026 501 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF844Q08AG5 666 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB110Q30KQ9 67 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERTAD3Q9UJW9 196 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNE2Q9Y6J6 123 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGF2RP11717 2491 aa31.78■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPTBP11277 2137 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7BY64 318 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCRTR1O43613 425 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTSVO60911 334 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 STK16O75716 305 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFAPP14136 432 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD82P27701 267 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA7P48741 367 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADCK2Q7Z695 626 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAQR7Q86WK9 346 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAP1Q96NZ9 151 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 APC2O95996 2303 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACACAQ13085 2346 aa31.77■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 TK2O00142 265 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK8O60259 260 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRP2O60462 931 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 RELAQ04206 551 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT71Q3SY84 523 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO48Q5FWF7 155 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF44Q7L0R7 432 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1L3Q8NH93 324 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBTD2Q8WUN7 234 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF11Q92914 225 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEIL2Q969S2 332 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZIM3Q96PE6 472 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM216Q9P0N5 145 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 PILRAQ9UKJ1 303 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 DYRK1BQ9Y463 629 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDK2Q58EX2 2172 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM8BA6NDV4 472 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH1P12830 882 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 EZRP15311 586 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT4P19013 534 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGA1P56199 1179 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFKFB4Q16877 469 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD11Q8NFV4 315 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESAMQ96AP7 390 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD244Q9BZW8 370 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLRA3O75311 464 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SETDB1Q15047 1291 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRABD2AQ86V40 505 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR135Q8IZ08 494 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM151AQ8N4L1 468 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC5A11Q8WWX8 675 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC11Q9NVH1 559 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMCO1Q9UM00 188 aa31.75■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPRP12270 2363 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACACBO00763 2458 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIAF1O95411 115 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCT5P48643 541 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO42Q6P3S6 717 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRIG3Q6UXM1 1119 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CROCCP2Q86T23 111 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPS2Q9BXY5 557 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ULBP3Q9BZM4 244 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPRC5BQ9NZH0 403 aa31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms