RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNIQ14094 377 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 DPP10Q8N608 796 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM145Q8NBT3 493 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 GUCD1Q96NT3 240 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAMK1GQ96NX5 476 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 LTB4R2Q9NPC1 389 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 SH2B3Q9UQQ2 575 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 DMTF1Q9Y222 760 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL6P05231 212 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDT1P36639 197 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLDN8P56748 225 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 STARD6P59095 220 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 TFF2Q03403 129 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT33BQ14525 404 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLCA4Q14CN2 919 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATS1Q496A3 300 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAGE3Q5JUK9 113 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR153Q6NV75 609 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRR23BQ6ZRT6 265 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 HUS1BQ8NHY5 278 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDXPQ96GD0 296 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 APOLD1Q96LR9 279 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLMPQ9H6B4 373 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL1RL2Q9HB29 575 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 NMRK1Q9NWW6 199 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCD2Q9UBJ2 740 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCM1Q15154 2024 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 FXYD1O00168 92 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 KDM1AO60341 852 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGHV4-34P06331 123 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 C17orf64Q86WR6 236 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF148Q8N7C7 305 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 SH3KBP1Q96B97 665 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 NELL2Q99435 816 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PELI2Q9HAT8 420 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD300AQ9UGN4 299 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIPSLA2A3N6 862 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGEB17A8MXT2 336 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF217O75362 1048 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYO1DO94832 1006 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RABIFP47224 123 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC7A2P52569 658 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHEXP78562 749 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 FLOT2Q14254 428 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBXN2BQ14CS0 331 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOXRED1Q6NXP6 359 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 WASH2PQ6VEQ5 465 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT78Q8N1N4 520 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF175Q8N4F7 328 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASB9Q96DX5 294 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 EBF2Q9HAK2 575 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 WASH6PQ9NQA3 447 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 STOML1Q9UBI4 398 aa28.09■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD6P30203 668 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB28P51157 221 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPE65Q16518 533 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC39A3Q9BRY0 314 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRDM8Q9NQV8 689 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXL21Q9UKT6 434 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-208ENST00000573600 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDH1P12830 882 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SDC1P18827 310 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXCR2P25025 360 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACSM2AQ08AH3 577 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 FZD5Q13467 585 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPRG1LQ5T0D9 272 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACSM2BQ68CK6 577 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARPINQ7Z6K5 226 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC26A7Q8TE54 656 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 S100A14Q9HCY8 104 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRM3Q9NNZ6 103 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAC3Q9UHF0 121 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa28.07■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRBA1A5PL33 1030 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC6A2P23975 617 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIK3CBP42338 1070 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC34A1Q06495 639 aa28.06■■■□□ 2.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAS6Q14393 721 aa28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms