RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564511.1

TUBGCP4-209, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 4, human

TSL 3

Gene TUBGCP4, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP4-209	ENST00000564511	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	EID2B	Q96D98	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	VPS11	Q9H270	941 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.96	□□□□□ -1.61
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PCDH17	O14917	1159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	KCNJ13	O60928	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FAM155B	O75949	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	OR2B3	O76000	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SLPI	P03973	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	UMOD	P07911	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SERPINB6	P35237	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GDF5	P43026	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	KLK7	P49862	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SMS	P52788	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	JAM2	P57087	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511		Q0VFX4	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	KRT33B	Q14525	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CAMK4	Q16566	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NR4A3	Q92570	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	HSPH1	Q92598	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	LMF1	Q96S06	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TUBGCP4-209	ENST00000564511	LHPP	Q9H008	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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