RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CARFQ8N187 725 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 TCF25Q9BQ70 676 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 MGME1Q9BQP7 344 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 SOX7Q9BT81 388 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 TRIM15Q9C019 465 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CD320Q9NPF0 282 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 LIASO43766 372 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 DNAJB6O75190 326 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 UGT2B11O75310 529 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 LEFTY1O75610 366 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 UPK1BO75841 260 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ZBTB7AO95365 584 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 RALBP11234 206 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC6A4P31645 630 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 HAAOP46952 286 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FMO5P49326 533 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CASP4P49662 377 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ADCY7P51828 1080 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PKNOX1P55347 436 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ALCAMQ13740 583 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF544Q6NX49 715 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CHSY3Q70JA7 882 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 UTS2BQ765I0 119 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PHC2Q8IXK0 858 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PALM2Q8IXS6 379 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 YAF2Q8IY57 180 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 TBCKQ8TEA7 893 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 APBB2Q92870 758 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FKBP10Q96AY3 582 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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TSPAN3-209ENST00000560715 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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TSPAN3-209ENST00000560715 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A087WWL8 130 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 C5orf51A6NDU8 294 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 E7ESA3 106 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 H3BM21 787 aa6.55□□□□□ -1.36
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TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF195O14628 629 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 GRM6O15303 877 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ADAMTS4O75173 837 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 UROSP10746 265 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 HGFP14210 728 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CKMT2P17540 419 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 TNFRSF1AP19438 455 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CHRM3P20309 590 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CHRNA5P30532 468 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 TALDO1P37837 337 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 GRIA1P42261 906 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF33BQ06732 778 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CHIT1Q13231 466 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 MANEALQ5VSG8 457 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 GPR156Q8NFN8 814 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 ZFP42Q96MM3 310 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 LHPPQ9H008 270 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN3-209ENST00000560715 WDCPQ9H6R7 721 aa6.55□□□□□ -1.36
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