RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 IQCKQ8N0W5 287 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MVB12AQ96EY5 273 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CRB3Q9BUF7 120 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 GALPQ9UBC7 116 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HECTD1Q9ULT8 2610 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 LRRK2Q5S007 2527 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ESPL1Q14674 2120 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 H0YGG7 62 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 NDC80O14777 642 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HAUS5O94927 633 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SLC16A8O95907 504 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 C8GP07360 202 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 UMODP07911 640 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HIST1H2ADP20671 130 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CXCR2P25025 360 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 GCGRP47871 477 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PTPN13Q12923 2485 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CRYMQ14894 314 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 BBS9Q3SYG4 887 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SLCO2A1Q92959 643 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CCDC138Q96M89 665 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.15■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 KRT87PA6NCN2 255 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 GFYI3L273 518 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 MAP2K7O14733 419 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 CCND1P24385 295 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SOX8P57073 446 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 GNG11P61952 73 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 MPP1Q00013 466 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 RELAQ04206 551 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 MORF4L2Q15014 288 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SLC6A19Q695T7 634 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 CD200R1Q8TD46 325 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 ZNF480Q8WV37 535 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 AGAP4Q96P64 663 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 CTSFQ9UBX1 484 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.14■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 E7ENX8 843 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 PCDH17O14917 1159 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SLC16A5O15375 505 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 UQCRHP07919 91 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 ACPPP15309 386 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 GRK3P35626 688 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 AVPR1BP47901 424 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 AP2B1P63010 937 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 DR1Q01658 176 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 TAP2Q03519 686 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SP140Q13342 867 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 FHL5Q5TD97 284 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 PAQR7Q86WK9 346 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.13■□□□□ 0.17
CASP9-211ENST00000546969 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms