RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 PHBP35232 272 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 SPRP35270 261 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 RRADP55042 308 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PTCHD3Q3KNS1 767 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 GRTP1Q5TC63 336 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 GARNL3Q5VVW2 1013 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 AGTRAPQ6RW13 159 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 FAM198BQ6UWH4 519 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 TTLL10Q6ZVT0 673 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 ADCK2Q7Z695 626 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 CEP112Q8N8E3 955 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 RNF31Q96EP0 1072 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 MVB12AQ96EY5 273 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 GPAMQ9HCL2 828 aa23.21■■□□□ 1.31
PITX3-202ENST00000539804 A0A0J9YVX5 310 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 HYKKA2RU49 373 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 KLHL41O60662 606 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ONECUT2O95948 504 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 FAM87AP0C7U9 286 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 SAT1P21673 171 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 FOLR3P41439 243 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 PMS2P54278 862 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 GUCY2DQ02846 1103 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 SSPNQ14714 243 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 MLIPQ5VWP3 458 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ZNF425Q6IV72 752 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 PAQR7Q86WK9 346 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 C17orf64Q86WR6 236 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 OLFM1Q99784 485 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 WDR54Q9H977 334 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 PSAT1Q9Y617 370 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 KCNMB2Q9Y691 235 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 LOC400499M0QZD8 3231 aa23.2■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 FAM159BA6NKW6 160 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 CTSVO60911 334 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 RFPL1O75677 317 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 TSPAN12O95859 305 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 HNMTP50135 292 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 TBPL1P62380 186 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 CDKL1Q00532 357 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 NDUFA9Q16795 377 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 C1orf189Q5VU69 101 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 LCTLQ6UWM7 567 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 EXD3Q8N9H8 876 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 FBXL8Q96CD0 374 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 RBBP8Q99708 897 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 SLC6A20Q9NP91 592 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 PCM1Q15154 2024 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 KRT87PA6NCN2 255 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 HCRTR1O43613 425 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 CAPN1P07384 714 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ANXA5P08758 320 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 STMN1P16949 149 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 GCGRP47871 477 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 SLC7A5Q01650 507 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 FBXO42Q6P3S6 717 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ZDHHC24Q6UX98 284 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 FRA10AC1Q70Z53 315 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 MED25Q71SY5 747 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ZNF843Q8N446 348 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 OR2Y1Q8NGV0 311 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 PTERQ96BW5 349 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.18■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 PEX12O00623 359 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 NAE1Q13564 534 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 USP10Q14694 798 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 CABS1Q96KC9 395 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 GPR22Q99680 433 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 SGPP1Q9BX95 441 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 DERL2Q9GZP9 239 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 SLC26A1Q9H2B4 701 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 ACSS2Q9NR19 701 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 STARD5Q9NSY2 213 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.17■■□□□ 1.3
PITX3-202ENST00000539804 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms