RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 WHRNQ9P202 907 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 EML5Q05BV3 1969 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SDK2Q58EX2 2172 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 OR5K3A6NET4 321 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 C9J4A7 227 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 STK17BO94768 372 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXL2P58012 376 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 LPGAT1Q92604 370 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC30A3Q99726 388 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 PADI1Q9ULC6 663 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 STMND1H3BQB6 276 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC7O00311 574 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TUBB4AP04350 444 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 GP1BAP07359 652 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 PCNAP12004 261 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 FOLR1P15328 257 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TSPAN8P19075 237 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 AGXTP21549 392 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CMPK1P30085 196 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 GP5P40197 560 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CAPZBP47756 277 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ACY1Q03154 408 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CHAF1BQ13112 559 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 GBX1Q14549 363 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 C17orf64Q86WR6 236 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TADA1Q96BN2 335 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TREX1Q9NSU2 369 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 MKS1Q9NXB0 559 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SNX7Q9UNH6 387 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 OR1F1O43749 312 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT37O76014 449 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT38O76015 456 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 WDR47O94967 919 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 MT-ND3P03897 115 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 DLSTP36957 453 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 OR1D4P47884 311 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 FASLGP48023 281 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 LSSP48449 732 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 HSD11B2P80365 405 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 HYAL2Q12891 473 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 DUPD1Q68J44 220 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM135Q86UB9 458 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 GPSM1Q86YR5 675 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 KCND1Q9NSA2 647 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms