RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF596Q8TC21 504 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1E3Q8WZA6 343 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 USP7Q93009 1102 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMG2Q969U7 264 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 AP2M1Q96CW1 435 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 REPS1Q96D71 796 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PBKQ96KB5 322 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ASB8Q9H765 288 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 GKN1Q9NS71 199 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 DPP3Q9NY33 737 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CTSFQ9UBX1 484 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PPT2Q9UMR5 302 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 AP1G1O43747 822 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 B4GALT3O60512 393 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CST8O60676 142 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 LGI1O95970 557 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC130P13994 396 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 NELFEP18615 380 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFRSF8P28908 595 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 VIPR2P41587 438 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 JAM2P57087 298 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MYBPC1Q00872 1141 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 GAD2Q05329 585 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR176Q14439 515 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCL1Q15111 1095 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT31Q15323 416 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF311Q5JNZ3 666 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MANEALQ5VSG8 457 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SETD9Q8NE22 299 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2L5Q8NG80 312 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf90Q96M02 699 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SEMA4CQ9C0C4 833 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MFFQ9GZY8 342 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TBX20Q9UMR3 447 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 DOCK5Q9H7D0 1870 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ATRXP46100 2492 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MYH11P35749 1972 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A087WWV3 80 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 M0QZQ0 153 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ITM2AO43736 263 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ENTPD5O75356 428 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 WDPCPO95876 746 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SYPP08247 313 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ADRB1P08588 477 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 RBP1P09455 135 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CXCL8P10145 99 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 RALBP11234 206 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CD36P16671 472 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SYKP43405 635 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 EPHA5P54756 1037 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFRSF17Q02223 184 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SLAQ13239 276 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CA9Q16790 459 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 C2CD6Q53TS8 623 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 LIPJQ5W064 366 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 VHLLQ6RSH7 139 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TSSK4Q6SA08 328 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CYS1Q717R9 158 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRPQ86YL5 185 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.45□□□□□ -1.7
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