RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TYMP	P19971	482 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	HERV-K104	P61576	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TAF10	Q12962	218 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	IFT172	Q9UG01	1749 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	IL11	P20809	199 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	JAK1	P23458	1154 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SLC6A12	P48065	614 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CCR3	P51677	355 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF75D	P51815	510 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SQLE	Q14534	574 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	HERC3	Q15034	1050 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	EID3	Q8N140	333 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MIS12	Q9H081	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ATRN	O75882	1429 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PXDN	Q92626	1479 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	LRP6	O75581	1613 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PTGES	O14684	152 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ADRB2	P07550	413 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CDH3	P22223	829 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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