RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 LGALS3BPQ08380 585 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TAF10Q12962 218 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TAF13Q15543 124 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SGCBQ16585 318 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 HFEQ30201 348 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ETFRF1Q6IPR1 90 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR141Q7Z602 305 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD46Q86W74 232 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 OR52N5Q8NH56 324 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ST7LQ8TDW4 575 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 MED30Q96HR3 178 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 IGSF21Q96ID5 467 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DUX5Q96PT3 197 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM7Q9C029 511 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TLE6Q9H808 572 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 KLK4Q9Y5K2 254 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 PLSCR5A0PG75 271 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 C17orf105B2RV13 164 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 PRSS46E5RG02 174 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ALPLP05186 524 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SBK2P0C263 348 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP2A7P20853 494 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 OR3A1P47881 315 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 GLIPR1P48060 266 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF132P52740 706 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CDH11P55287 796 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 IFI44LQ53G44 452 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DCAF10Q5QP82 559 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 RABEPKQ7Z6M1 372 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NAGSQ8N159 534 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC63Q8NA47 563 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NSL1Q96IY1 281 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF583Q96ND8 569 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 RASL10BQ96S79 203 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SPXQ9BT56 116 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SDCBP2Q9H190 292 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TNMDQ9H2S6 317 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 UBQLN3Q9H347 655 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CHST11Q9NPF2 352 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJC11Q9NVH1 559 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 IL19Q9UHD0 177 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 C2CD4DB7Z1M9 353 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAC2D3DTV9 90 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPN9O14815 690 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 VEGFDO43915 354 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SEC22BO75396 215 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DDHD2O94830 711 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 NR3C1P04150 777 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 GP1BBP13224 206 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TYMPP19971 482 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEB1P43366 347 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC12A3P55017 1021 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 STARD6P59095 220 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-207ENST00000470201 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.25□□□□□ -1.732e-9■■■□□ 17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms