RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TBX21Q9UL17 535 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ITM2BQ9Y287 266 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 WNT6Q9Y6F9 365 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 KLHL33A6NCF5 533 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 EVPLLA8MZ36 301 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CFAP99D6REC4 459 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 WNT9AO14904 365 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ABCB7O75027 752 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 FKBP9O95302 570 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ETHE1O95571 254 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 NTRK1P04629 796 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 NUDT7P0C024 238 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 JUPP14923 745 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 FSHRP23945 695 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 MAPK1P28482 360 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TTKP33981 857 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 PLA2G16P53816 162 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 NTHL1P78549 312 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 IL5RAQ01344 420 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ABHD18Q0P651 414 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 RAPSNQ13702 412 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 GBX1Q14549 363 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TRIM74Q86UV6 250 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CHPFQ8IZ52 775 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 PARP8Q8N3A8 854 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 PJA1Q8NG27 643 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TANKQ92844 425 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TESCQ96BS2 214 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CSF3RQ99062 836 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 DOK1Q99704 481 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ZBP1Q9H171 429 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 C3orf18Q9UK00 162 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CDH7Q9ULB5 785 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 HIDE1A8MVS5 230 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 BCKDKO14874 412 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 AXIN1O15169 862 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 SEC14L2O76054 403 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 INMTO95050 263 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 KCNK5O95279 499 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 SLC16A8O95907 504 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 GBAP04062 536 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CTSLP07711 333 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 MPC1LP0DKB6 136 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CTSAP10619 480 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CCNA2P20248 432 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 IGFBP5P24593 272 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 PDHA2P29803 388 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 FMO3P31513 532 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 WNT3P56703 355 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ISL1P61371 349 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 VLDLRP98155 873 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 NFATC3Q12968 1075 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 DUOXA1Q1HG43 343 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 HKDC1Q2TB90 917 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 CPZQ66K79 652 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 LILRA6Q6PI73 481 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-204ENST00000451422 IRF7Q92985 503 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms