RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439421.2

AL355500.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL355500.1, Length 297 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL355500.1-201ENST00000439421 ANXA5P08758 320 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 ICAM2P13598 275 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 CCNFP41002 786 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF33BQ06732 778 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 TESK1Q15569 626 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 TMEM205Q6UW68 189 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 AMER3Q8N944 861 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 PEX13Q92968 403 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 F8P00451 2351 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.65□□□□□ -0.54
AL355500.1-201ENST00000439421 RCCD1A6NED2 376 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 H0YGG7 62 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 C19orf84I3L1E1 186 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 MLYCDO95822 493 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ERGP11308 486 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CAPN3P20807 821 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SLC26A3P40879 764 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SPA17Q15506 151 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF766Q5HY98 468 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CDH24Q86UP0 819 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF778Q96MU6 729 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 GPR137Q96N19 417 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 FOPNLQ96NB1 174 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 DPH7Q9BTV6 452 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CENPEQ02224 2701 aa11.64□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 A0A0U1RQJ8 604 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 KPNA5O15131 536 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 FOXS1O43638 330 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SUN1O94901 812 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CYC1P08574 325 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ADRA1DP25100 572 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 TTPAP49638 278 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 EFNA3P52797 238 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CDSNQ15517 529 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 HKDC1Q2TB90 917 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 PAQR7Q86WK9 346 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CEP97Q8IW35 865 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 IMMP1LQ96LU5 166 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 DRC3Q9H069 523 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 P2RY12Q9H244 342 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 MEMO1Q9Y316 297 aa11.63□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 APCP25054 2843 aa11.62□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 SVILO95425 2214 aa11.62□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
AL355500.1-201ENST00000439421 ASPDHA6ND91 283 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms