RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF221Q9UK13 617 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OR6C75A6NL08 312 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MANBAO00462 879 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KMOO15229 486 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VNN2O95498 520 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ITGB6P18564 788 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CDKN2CP42773 168 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NEK2P51955 445 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CLDN8P56748 225 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FUT10Q6P4F1 479 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD46Q86W74 232 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PGBD3Q8N328 593 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MKLN1Q9UL63 735 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OARD1Q9Y530 152 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 A6NL46 340 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC6A4P31645 630 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DOK6Q6PKX4 331 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINA11Q86U17 422 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TTC16Q8NEE8 873 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 USP7Q93009 1102 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MYDGFQ969H8 173 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CD244Q9BZW8 370 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 REEP1Q9H902 201 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CENPBD1B2RD01 187 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 H7C0S8 307 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GRK5P34947 590 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ETV6P41212 452 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GDF5P43026 501 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ITGA1P56199 1179 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DMPKQ09013 629 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC14A1Q13336 389 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF544Q6NX49 715 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DENND1CQ8IV53 801 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EFHBQ8N7U6 833 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EGFL8Q99944 293 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NTMT1Q9BV86 223 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MARCH5Q9NX47 278 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 WWOXQ9NZC7 414 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZW10O43264 779 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EBLN1P0CF75 366 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CR2P20023 1033 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SP3Q02447 781 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GPR17Q13304 367 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MLIPQ5VWP3 458 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SPATC1Q76KD6 591 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SNX18Q96RF0 628 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NUAK2Q9H093 628 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 34.7
TOP3B-206ENST00000436282 EHD3Q9NZN3 535 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EVPLLA8MZ36 301 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ADAM12O43184 909 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN3O60637 253 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GJB5O95377 273 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV3-27P01718 113 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CDK1P06493 297 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO43Q4G163 708 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ULK4Q96C45 1275 aa14.49□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms