RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 LHPPQ9H008 270 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 GALPQ9UBC7 116 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 TAC3Q9UHF0 121 aa14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 H0YGG7 62 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 MASP2O00187 686 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 KIF5CO60282 957 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 SLC16A8O95907 504 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 MPC1LP0DKB6 136 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 ACPPP15309 386 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 CXCR2P25025 360 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 RELAQ04206 551 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 KLC1Q07866 573 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 CTBP1Q13363 440 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 CYP1B1Q16678 543 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 ICE2Q659A1 982 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 PRR7Q8TB68 274 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 ASB11Q8WXH4 323 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 MS4A14Q96JA4 679 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 C3orf18Q9UK00 162 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 DHRS7Q9Y394 339 aa14.46□□□□□ -0.09
HERC3-206ENST00000431413 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 E7ENX8 843 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 SMAPO00193 183 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 MAP2K7O14733 419 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PCDH17O14917 1159 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 DDAH2O95865 285 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 ANXA5P08758 320 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 SLC1A2P43004 574 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 GLRBP48167 497 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 FNTAP49354 379 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 TAP2Q03519 686 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 CUL1Q13616 776 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PTK6Q13882 451 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 ADCK2Q7Z695 626 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PAQR7Q86WK9 346 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 ZNF480Q8WV37 535 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PCSK5Q92824 1860 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 C19orf60Q96EN9 201 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 ESPL1Q14674 2120 aa14.45□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 GFYI3L273 518 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 NRP2O60462 931 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 HPP00738 406 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 HRH2P25021 359 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 MAGEA3P43357 314 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 DSG2Q14126 1118 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 NR6A1Q15406 480 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R7Q15435 360 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 NDUFA9Q16795 377 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 ZNF425Q6IV72 752 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 PALM2Q8IXS6 379 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 C10orf90Q96M02 699 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 GPR21Q99679 349 aa14.44□□□□□ -0.1
HERC3-206ENST00000431413 SLC30A3Q99726 388 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms