RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IMPA1P29218 277 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC12A2P55011 1212 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLRB1Q12918 225 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP1A4Q13733 1029 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR2Y1Q8NGV0 311 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL26A1Q96A83 441 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM4Q9C037 500 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDC14AQ9UNH5 594 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VWA7Q9Y334 891 aa15.53■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL6A6A6NMZ7 2263 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATMQ13315 3056 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FITM1A5D6W6 292 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TXNDC9O14530 226 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAD51CO43502 376 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALBP02768 609 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HRH2P25021 359 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBPL1P62380 186 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAV1Q03135 178 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRGPREQ86SM8 312 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PAQR7Q86WK9 346 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VPS39Q96JC1 886 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR54Q9H977 334 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL15Q9NXU5 204 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDC23Q9UJX2 597 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDE10AQ9Y233 779 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.52■□□□□ 0.08
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A6NL46 340 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 E7ESA3 106 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H0YGG7 62 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRP2O60462 931 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPTBP11277 2137 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NR1D1P20393 614 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRK3P35626 688 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CASRP41180 1078 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR1D4P47884 311 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OCA2Q04671 838 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TLE1Q04724 770 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C17orf64Q86WR6 236 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATL1Q8WXF7 558 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPR83Q9NYM4 423 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.51■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H7BY64 318 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLHL41O60662 606 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANXA5P08758 320 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FDXRP22570 491 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AP1S2P56377 157 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDUFA9Q16795 377 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF425Q6IV72 752 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC25Q86WR0 208 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NACC2Q96BF6 587 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms