RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa20.01■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 FAM136AQ96C01 138 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 MIEF2Q96C03 454 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.01■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 SDR42E2A6NKP2 422 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 H0YGG7 62 aa20■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 KRT14P02533 472 aa20■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 CYP1B1Q16678 543 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 ATG9BQ674R7 924 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 TTC27Q6P3X3 843 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 PRR7Q8TB68 274 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINB12Q96P63 405 aa20■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ICE1Q9Y2F5 2266 aa20■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 MAP2K7O14733 419 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ALOX12BO75342 701 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A8O95907 504 aa19.99■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa19.99■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC26A3P40879 764 aa19.98■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 Q0VFX4 171 aa19.98■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 CSNK1A1LQ8N752 337 aa19.98■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa19.98■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 CCDC68Q9H2F9 335 aa19.98■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 C3orf18Q9UK00 162 aa19.98■□□□□ 0.79
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LIMS1-208ENST00000428064 JRKLQ9Y4A0 524 aa19.98■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 UNC79Q9P2D8 2635 aa19.98■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 NRDCO43847 1150 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 SLC1A2P43004 574 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 TERF1P54274 439 aa19.97■□□□□ 0.79
LIMS1-208ENST00000428064 MFAP5Q13361 173 aa19.97■□□□□ 0.79
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