RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.88■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 RNF112Q9ULX5 631 aa22.88■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 SHBGP04278 402 aa22.87■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 ISL2Q96A47 359 aa22.87■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.86■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 ESX1Q8N693 406 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC77Q9BR77 488 aa22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.86■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 HNMTP50135 292 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 MAP7Q14244 749 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 MANEAQ5SRI9 462 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 LGSNQ5TDP6 509 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 BROXQ5VW32 411 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF44Q7L0R7 432 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 C17orf64Q86WR6 236 aa22.85■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.85■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.85■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 SSUH2Q9Y2M2 353 aa22.85■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHL2O95198 593 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 HSD17B3P37058 310 aa22.84■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 PLD3Q8IV08 490 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 HAUS8Q9BT25 410 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 CD274Q9NZQ7 290 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa22.84■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 MT-ND3P03897 115 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 CDH1P12830 882 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 GDF5P43026 501 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 CRELD1Q96HD1 420 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR78Q96P69 363 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ATOH8Q96SQ7 321 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF358Q9NW07 568 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 TBK1Q9UHD2 729 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 PADI1Q9ULC6 663 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
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UBE2E3-202ENST00000410062 EFSO43281 561 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 KERAO60938 352 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 STAT5AP42229 794 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ABHD18Q0P651 414 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 EMBQ6PCB8 327 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 ESAMQ96AP7 390 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.83■■□□□ 1.25
UBE2E3-202ENST00000410062 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.83■■□□□ 1.25
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