RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 MED27Q6P2C8 311 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf74Q86VG3 221 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 LONP2Q86WA8 852 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SNX32Q86XE0 403 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 LAS2Q8IYD9 372 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 KRT78Q8N1N4 520 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 AVL9Q8NBF6 648 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 OR2T11Q8NH01 316 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ROPN1LQ96C74 230 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 HHIPQ96QV1 700 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 OR4K3Q96R72 315 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SERPINI1Q99574 410 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 MENTQ9BUN1 341 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 KCNK6Q9Y257 313 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-202ENST00000409024 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FAM234BA2RU67 622 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 E7EQ34 232 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MGRN1O60291 552 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NRP2O60462 931 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRMT3O60678 531 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KRT34O76011 436 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PDYNP01213 254 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 JAK1P23458 1154 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PKLRP30613 574 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SHMT2P34897 504 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 HTR6P50406 440 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KCNK10P57789 538 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KCNJ2P63252 427 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRKG2Q13237 762 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ART3Q13508 389 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CUL3Q13618 768 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CLCA4Q14CN2 919 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RPE65Q16518 533 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ALG11Q2TAA5 492 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MMEL1Q495T6 779 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 C17orf64Q86WR6 236 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 STARD8Q92502 1023 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NEIL2Q969S2 332 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FCRL1Q96LA6 429 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ZBTB18Q99592 522 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FOXQ1Q9C009 403 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 EBF2Q9HAK2 575 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CD93Q9NPY3 652 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 GID8Q9NWU2 228 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.46□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0G2JNG1 304 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PP18 115 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 A6NCN8 305 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FFAR3O14843 346 aa9.45□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 AXIN1O15169 862 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms