RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

BASIC

Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 SDE2Q6IQ49 451 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 OR52J3Q8NH60 311 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CD200R1Q8TD46 325 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SPASTQ9UBP0 616 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.81□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TEX28O15482 410 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TNFRSF1BP20333 461 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TACR1P25103 407 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 UQCRC1P31930 480 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ZNF79Q15937 498 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ATG9BQ674R7 924 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 PLPP6Q8IY26 295 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TRIM63Q969Q1 353 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 VPS35Q96QK1 796 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RLIMQ9NVW2 624 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SMIM30A4D0T7 59 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 FAM25AB3EWG3 89 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 FAM25CB3EWG5 89 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 FAM25GB3EWG6 89 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 HAS3O00219 553 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TREHO43280 583 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 GPX5O75715 221 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ITGA2P17301 1181 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 EFR3AQ14156 821 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ASB15Q8WXK1 588 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 FCGR1BQ92637 280 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 MYDGFQ969H8 173 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TMCO6Q96DC7 493 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CLMPQ9H6B4 373 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 REEP1Q9H902 201 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RRAGCQ9HB90 399 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 STMN3Q9NZ72 180 aa14.8□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CDK2AP1O14519 115 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 VPS26AO75436 327 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 IL6P05231 212 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 BCKDHAP12694 445 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SSTR4P31391 388 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 MXD1Q05195 221 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RMDN1Q96DB5 314 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RERGLQ9H628 205 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 POU2F1P14859 743 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 LIMK1P53667 647 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 DMC1Q14565 340 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SCD5Q86SK9 330 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 GLRX5Q86SX6 157 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 LPPQ93052 612 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 FEVQ99581 238 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 V9GYH0 126 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 E5RI56 91 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 ZXDBP98169 803 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SNX18-202ENST00000343017 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms