RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 ST3GAL3Q11203 375 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 LRRC58Q96CX6 371 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 KLHL15Q96M94 604 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 ADAM2Q99965 735 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 TTYH3Q9C0H2 523 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 CAPN14A8MX76 684 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRB-202ENST00000334414 NOXA1Q86UR1 476 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 OR10A6Q8NH74 314 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 CXorf40BQ96DE9 158 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PPM1MQ96MI6 270 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-202ENST00000334414 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.39□□□□□ -1.55
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