RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 BROXQ5VW32 411 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ADHFE1Q8IWW8 467 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 OR52E4Q8NGH9 312 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 THAP11Q96EK4 314 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PYURFQ96I23 114 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 RMND5AQ9H871 391 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 AASSQ9UDR5 926 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 LAG3P18627 525 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TTKP33981 857 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ETV3P41162 512 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ABRQ12979 859 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 BNIP3Q12983 259 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 SPARTQ8N0X7 666 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 EID3Q8N140 333 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 SVOPLQ8N434 492 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TANKQ92844 425 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 RNF208Q9H0X6 261 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.87■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TESCQ96BS2 214 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 SIAEQ9HAT2 523 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 SACM1LQ9NTJ5 587 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 USE1Q9NZ43 259 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ABCG2Q9UNQ0 655 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 A8MU76 341 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PTGES3LE9PB15 166 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 GRM6O15303 877 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 YY2O15391 372 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ABCB7O75027 752 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 FKTNO75072 461 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGEF15O94989 841 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 NR4A1P22736 598 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 HNMTP50135 292 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 FAM209AQ5JX71 171 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM215Q68D42 235 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.86■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 WNT9AO14904 365 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 SEC14L2O76054 403 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CYP2A7P20853 494 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 KIR3DL1P43629 444 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ISL1P61371 349 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ABHD18Q0P651 414 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 UGT8Q16880 541 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CEP68Q76N32 757 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 TCAIMQ8N3R3 496 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PANX1Q96RD7 426 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CSF3RQ99062 836 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 C5orf42Q9H799 3197 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 A6NL46 340 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ENGP17813 658 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PRPH2P23942 346 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 ITGB8P26012 769 aa15.85■□□□□ 0.13
SHQ1-201ENST00000325599 PCYT1AP49585 367 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms