RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 CD320Q9NPF0 282 aa20.84■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 C1orf109Q9NX04 203 aa20.84■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 USP22Q9UPT9 525 aa20.84■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 DYTNA2CJ06 578 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 QSOX1O00391 747 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 CLPXO76031 633 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 NCK1P16333 377 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 PRLHRP49683 370 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 CD300CQ08708 224 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 COQ10AQ96MF6 247 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 DPY30Q9C005 99 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 HPS4Q9NQG7 708 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 K7ESM1 405 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 BDKRB1P46663 353 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 SLC36A3Q495N2 470 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 LCN8Q6JVE9 175 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 DPP10Q8N608 796 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 TPK1Q9H3S4 243 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 SNX6Q9UNH7 406 aa20.83■□□□□ 0.93
MESP1-201ENST00000300057 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 PSMD11O00231 422 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 PRAMEF4O60810 478 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 C7P10643 843 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 PCYT1AP49585 367 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 PFN3P60673 137 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 HID1Q8IV36 788 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 AQP12BA6NM10 295 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 DLGAP1O14490 977 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 ALOX5P09917 674 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 GSSP48637 474 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 MTPNP58546 118 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 INPP5AQ14642 412 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 KIAA0040Q15053 153 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 CBR4Q8N4T8 237 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 TMIEQ8NEW7 156 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 NUS1Q96E22 293 aa20.82■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 DHRS12A0PJE2 317 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 ARNTLO00327 626 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 MMP20O60882 483 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SOD1P00441 154 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 NPPAP01160 153 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 C6P13671 934 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 ADRB3P13945 408 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 CHIT1Q13231 466 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SELPLGQ14242 412 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SHHQ15465 462 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SMU1Q2TAY7 513 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SPATS1Q496A3 300 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 TBCELQ5QJ74 424 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 MED8Q96G25 268 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 ZNF347Q96SE7 839 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 FAM129BQ96TA1 746 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 C8orf4Q9NR00 106 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 H0Y858 1186 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 BCKDHAP12694 445 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 FCARP24071 287 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 PDHA2P29803 388 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 OXTRP30559 389 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 ELP6Q0PNE2 266 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.81■□□□□ 0.92
MESP1-201ENST00000300057 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms