RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF20P17024 532 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD17B2P37059 387 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3CBP42338 1070 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SMSP52788 366 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 AMZ2Q86W34 360 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLQ8NG68 377 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 GALPQ9UBC7 116 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ALPIP09923 528 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP1BP68106 108 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FRG2Q64ET8 278 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 NUS1Q96E22 293 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FRG2BQ96QU4 278 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAP2Q9NPF8 381 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD19C9JJ37 291 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CCRL2O00421 344 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL2Q9H1P3 480 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CYB5AP00167 134 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBA3CQ13748 450 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 DPEP2Q9H4A9 486 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 PLSCR1O15162 318 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CDRT1O95170 752 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SCNN1AP37088 669 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 PCLAFQ15004 111 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A15Q8IZD6 547 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC29A3Q9BZD2 475 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CMAHPQ9Y471 501 aa23.56■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL9Q6T311 187 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4F6Q8NGB9 312 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RELTQ969Z4 430 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB118Q96PH6 123 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB11Q9BUY7 163 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 HPF1Q9NWY4 346 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF773Q6PK81 442 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 VITQ6UXI7 678 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 HSH2DQ96JZ2 352 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM74Q96NL1 305 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CARD8Q9Y2G2 431 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RB1P06400 928 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJB1P25685 340 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 GAD2Q05329 585 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SYVN1Q86TM6 617 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 NATD1Q8N6N6 113 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 KCT2Q8NC54 265 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR22Q99680 433 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 MANBAO00462 879 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 KLK1P06870 262 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FOSL2P15408 326 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL26Q53HC5 615 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SPAG16Q8N0X2 631 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 AQP11Q8NBQ7 271 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 PROKR2Q8NFJ6 384 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 OR9I1Q8NGQ6 314 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RGMAQ96B86 450 aa23.55■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CREG1O75629 220 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN2P17706 415 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FPR1P21462 350 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC37A3Q8NCC5 494 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCG2Q9UNQ0 655 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 GLIS1Q8NBF1 620 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF6Q9Y252 685 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PP18 115 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC7O00311 574 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM110Q86TL2 294 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCB7O75027 752 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 AIFM2Q9BRQ8 373 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR68Q15743 365 aa23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG5Q9Y673 324 aa23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms