RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 UBXN11Q5T124 520 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 RGMBQ6NW40 437 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SCD5Q86SK9 330 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 GHDCQ8N2G8 530 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FEVQ99581 238 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CENPOQ9BU64 300 aa14.89□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PQ72 361 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 M0QX08 132 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 E2F3O00716 465 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TRBC1P01850 177 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CAPNS1P04632 268 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SSTR4P31391 388 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 HNF4AP41235 474 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 QPRTQ15274 297 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CTRCQ99895 268 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SSX4O60224 188 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CCNDBP1O95273 360 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 NPPAP01160 153 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TYMPP19971 482 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PTNP21246 168 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 GKP32189 559 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CA5AP35218 305 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 RGRP47804 291 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ALDH9A1P49189 494 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MVKQ03426 396 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PARP15Q460N3 678 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FAM25AB3EWG3 89 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FAM25CB3EWG5 89 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 FAM25GB3EWG6 89 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 VLDLRP98155 873 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CPZQ66K79 652 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TRIM69Q86WT6 500 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 DNASE1L2Q92874 299 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 VNN3Q9NY84 501 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TACR1P25103 407 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TUBA1BP68363 451 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 DUSP4Q13115 394 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SERINC3Q13530 473 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TUBA1AQ71U36 451 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 KRT73Q86Y46 540 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 LGI4Q8N135 537 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CD200R1Q8TD46 325 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CLN6Q9NWW5 311 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TTC34A8MYJ7 566 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MTX2O75431 263 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ESR1P03372 595 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PSKH1P11801 424 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CDKN2CP42773 168 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 PTPN5P54829 565 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 ABHD18Q0P651 414 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 GRIK2Q13002 908 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CBLBQ13191 982 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 XKR6Q5GH73 641 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CASP12Q6UXS9 341 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 GKN1Q9NS71 199 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 UPK1AO00322 258 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC10A3P09131 477 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 TNNI3P19429 210 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 KDELR2P33947 212 aa14.87□□□□□ -0.03
USP25-201ENST00000285679 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms