RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SMSP52788 366 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 G6PDP11413 515 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 BLKP51451 505 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 IQCHQ86VS3 1027 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 NXPE1Q8N323 547 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OR6K6Q8NGW6 343 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ANKHQ9HCJ1 492 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 IL36AQ9UHA7 158 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MARK1Q9P0L2 795 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 LINGO3P0C6S8 592 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 XKR4Q5GH76 650 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SIX4Q9UIU6 781 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DCLK1O15075 740 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RB1P06400 928 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT2P55345 433 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SMPDL3AQ92484 453 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A3Q99624 504 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SMOQ99835 787 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA10O75578 1167 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 VIPR1P32241 457 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CASP9P55211 416 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA3AQ14563 771 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ARSIQ5FYB1 569 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OSTM1Q86WC4 334 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ9Q92806 393 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 UCK2Q9BZX2 261 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF432O94892 652 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 INMTO95050 263 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OPN1SWP03999 348 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCGP05129 697 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PEBP4Q96S96 227 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MND1Q9BWT6 205 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 M0QX08 132 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GMFGO60234 142 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA3DO95025 777 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TLR1Q15399 786 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RDH12Q96NR8 316 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRU2 124 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 KDELR3O43731 214 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF3P17036 446 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH7Q9H992 704 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RFPL1O75677 317 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SP140Q13342 867 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF773Q6PK81 442 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NCSTNQ92542 709 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PKP4Q99569 1192 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RCBTB2O95199 551 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KLK1P06870 262 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CD72P21854 359 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KCNQ1P51787 676 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SFT2D3Q587I9 215 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ELOA3Q8NG57 546 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 DMRTB1Q96MA1 342 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MED11Q9P086 117 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 A0A075B6Q4 140 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF11O60813 436 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SLC15A1P46059 708 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MOGQ16653 247 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RABL3Q5HYI8 236 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 BORCS6Q96GS4 357 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 IL12RB2Q99665 862 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 AHCYP23526 432 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms