RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-222ENST00000630804 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MT-ND1P03886 318 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CD36P16671 472 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ADH6P28332 368 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 LIMK2P53671 638 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MAMLD1Q13495 774 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MLC1Q15049 377 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 SEC23BQ15437 767 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PARP15Q460N3 678 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MOB2Q70IA6 237 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 GPAT4Q86UL3 456 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CBR4Q8N4T8 237 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 OR7G2Q8NG99 324 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 KLRG1Q96E93 195 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MIOSQ9NXC5 875 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 M0QX08 132 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 SLC22A1O15245 554 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 OR1F1O43749 312 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MFSD11O43934 449 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 FUT4P22083 530 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 UGT1A3P35503 534 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF529Q6P280 563 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 NPNTQ6UXI9 565 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 GPR151Q8TDV0 419 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 THEM6Q8WUY1 208 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 FEM1CQ96JP0 617 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CAPNS2Q96L46 248 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 HES2Q9Y543 173 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PRNPP04156 253 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 GNSP15586 552 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ALDH3B1P43353 468 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ENTPD1P49961 510 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 LRRC66Q68CR7 880 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 KCNN1Q92952 543 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 LPPQ93052 612 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 TM9SF2Q99805 663 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 TSTD3H0UI37 97 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ACTL6BO94805 426 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 XKP51811 444 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MAXP61244 160 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ARHGAP8P85298 464 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MED27Q6P2C8 311 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 OR8S1Q8NH09 359 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 RNF157Q96PX1 679 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 WACQ9BTA9 647 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.05□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 FAM234BA2RU67 622 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PCCBP05166 539 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 SLC15A1P46059 708 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ALDH3B2P48448 385 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 NXPE1Q8N323 547 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PSKH2Q96QS6 385 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 LRFN1Q9P244 771 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 SYN3O14994 580 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 FCER2P06734 321 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 KHKP50053 298 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 CASP6P55212 293 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 FOXM1Q08050 763 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNF616Q08AN1 781 aa8.04□□□□□ -1.12
SPTAN1-222ENST00000630804 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms