RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM170AA1A519 330 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TTC34A8MYJ7 566 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM72CH0Y354 149 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 H0Y3Z8 333 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 I6L893 689 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DFFAO00273 331 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RASGRF2O14827 1237 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PFDN6O15212 129 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALOX15BO15296 676 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TP73O15350 636 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADAM12O43184 909 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPRY2O43597 315 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRAMEF11O60813 436 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT38O76015 456 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FGF1P05230 155 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 POLBP06746 335 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CA3P07451 260 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERPINF2P08697 491 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 JUPP14923 745 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ENGP17813 658 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PGAM1P18669 254 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HLA-DPA1P20036 260 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MATN1P21941 496 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRKCHP24723 683 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNAJB1P25685 340 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTPN3P26045 913 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DUSP1P28562 367 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERPINA4P29622 427 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 OAS2P29728 719 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPL22P35268 128 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HADHAP40939 763 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAGEA4P43358 317 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MMP13P45452 471 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 POLD2P49005 469 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NPY2RP49146 381 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 VPS41P49754 854 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCT8P50990 548 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLK1P53350 603 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC18A1P54219 525 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PNLIPRP1P54315 467 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 AP1S1P61966 158 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CFHR3Q02985 330 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GNA12Q03113 381 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNAJC3Q13217 504 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF235Q14590 738 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DUSP6Q16828 381 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 UGP2Q16851 508 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT71Q3SY84 523 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCID2Q5JVF3 399 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPANXN3Q5MJ09 141 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM72AQ5TYM5 149 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 STEAP4Q687X5 459 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCTD11Q693B1 232 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM72DQ6L9T8 149 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LIN54Q6MZP7 749 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RETSATQ6NUM9 610 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FBXL22Q6P050 247 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PID1Q7Z2X4 250 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GALNT7Q86SF2 657 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC25Q86WR0 208 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM72BQ86X60 149 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TDHQ8IZJ6 230 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CMTM8Q8IZV2 173 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LGI2Q8N0V4 545 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR4N4Q8N0Y3 316 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF567Q8N184 647 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PYROXD2Q8N2H3 581 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TEX26Q8N6G2 289 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NPWQ8N729 165 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR150Q8NGU9 434 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM76AQ8TAV0 307 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GLMPQ8WWB7 406 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms