RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 GABRA4P48169 554 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TBPL1P62380 186 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PYCR2Q96C36 320 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 MTBPQ96DY7 904 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 EGFL8Q99944 293 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 DPH7Q9BTV6 452 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SGPP1Q9BX95 441 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SPRY4Q9C004 299 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ALG9Q9H6U8 611 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FANCEQ9HB96 536 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RNF112Q9ULX5 631 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RAXQ9Y2V3 346 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 LAMA5O15230 3695 aa15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ACACBO00763 2458 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RFPL1O75677 317 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CCNDBP1O95273 360 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TIAF1O95411 115 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NPPBP16860 134 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZNF28P17035 718 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CCND1P24385 295 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 HNMTP50135 292 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ABATP80404 500 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ACAP2Q15057 778 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 LCTLQ6UWM7 567 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 OR8K5Q8NH50 307 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 OR1L3Q8NH93 324 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 RNF31Q96EP0 1072 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 GPR78Q96P69 363 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TBK1Q9UHD2 729 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 IGF2RP11717 2491 aa15.96■□□□□ 0.15
IRF1-211ENST00000613424 TAPBPO15533 448 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 NRP2O60462 931 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 CTSVO60911 334 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 SLCO1A2P46721 670 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 GLRBP48167 497 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 NAA25Q14CX7 972 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 TDRPQ86YL5 185 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 RHEBL1Q8TAI7 183 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 PPCSQ9HAB8 311 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 ZNF358Q9NW07 568 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 EURLQ9NYK6 297 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 CD274Q9NZQ7 290 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 SNX7Q9UNH6 387 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 APC2O95996 2303 aa15.95■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 SDK2Q58EX2 2172 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 OR2A25A4D2G3 310 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 H3BMH7 237 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 STMND1H3BQB6 276 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 H7BY64 318 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 KERAO60938 352 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 STK17BO94768 372 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 KIAA0754O94854 1291 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 CTSBP07858 339 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 NUDT17P0C025 328 aa15.94■□□□□ 0.14
IRF1-211ENST00000613424 COL6A2P12110 1019 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms