RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597151.1

LTBP4-217, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene LTBP4, Length 285 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-217ENST00000597151 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 CTAGE9A4FU28 777 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 CCZ1BP86790 482 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 NR6A1Q15406 480 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 RBBP7Q16576 425 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 TTC27Q6P3X3 843 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 RNF44Q7L0R7 432 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PRR7Q8TB68 274 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PKP4Q99569 1192 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 MAGEB16A2A368 324 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 OR2A25A4D2G3 310 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 VSTM2BA6NLU5 285 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 MYO1CO00159 1063 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ERVK-10P10266 1014 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ERGP11308 486 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 GLRBP48167 497 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 CLCN7P51798 805 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 OCA2Q04671 838 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 NAA25Q14CX7 972 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ARMC3Q5W041 872 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 SMPDL3AQ92484 453 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 INPP5DQ92835 1189 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 MS4A14Q96JA4 679 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 CRB3Q9BUF7 120 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.58□□□□□ -0.07
LTBP4-217ENST00000597151 H0YGG7 62 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 USP1O94782 785 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 CATP04040 527 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 MLNP12872 115 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 PNLIPRP1P54315 467 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 CTBP1Q13363 440 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 HIF1AQ16665 826 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 MUM1Q2TAK8 710 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 C4orf17Q53FE4 359 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 Q6ZS92 163 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 CUZD1Q86UP6 607 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 MIEF2Q96C03 454 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 VPS50Q96JG6 964 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 CABS1Q96KC9 395 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 AGAP4Q96P64 663 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 SLC30A3Q99726 388 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBP4-217ENST00000597151 NRDCO43847 1150 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms