RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CDKN2D	P55273	166 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CAV1	Q03135	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TAP2	Q03519	686 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TLE1	Q04724	770 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	NDC1	Q9BTX1	674 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507		A0A0J9YVX5	310 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FITM1	A5D6W6	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	WISP1	O95388	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ONECUT2	O95948	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ITGA8	P53708	1063 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	COX15	Q7KZN9	410 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507		C9J4A7	227 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CEACAM4	O75871	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FKBP9	O95302	570 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TTC4	O95801	387 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	OTX2	P32243	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CASR	P41180	1078 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	OR1D4	P47884	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SSPN	Q14714	243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PAQR7	Q86WK9	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	IFT20	Q8IY31	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CERS2	Q96G23	380 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TAC3	Q9UHF0	121 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PDE10A	Q9Y233	779 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SPTB	P11277	2137 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507		A0A1B0GX78	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507		A6NL46	340 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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