RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.18■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.18■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.18■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ADAMTS20P59510 1910 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 EFSO43281 561 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF749O43361 778 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM155BO75949 473 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 INHBAP08476 426 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANXA5P08758 320 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC166P0CW27 439 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARSFP54793 590 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CDKL1Q00532 357 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 RELAQ04206 551 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 NAE1Q13564 534 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBXL8Q96CD0 374 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 MED8Q96G25 268 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 HAUS8Q9BT25 410 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 NDC1Q9BTX1 674 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 OARD1Q9Y530 152 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 LAMA5O15230 3695 aa20.17■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CACNA1BQ00975 2339 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR2A25A4D2G3 310 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 C21orf140B9A014 251 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 MEN1O00255 615 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 GUCA1CO95843 209 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 LIFP15018 202 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TCN2P20062 427 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 AGXTP21549 392 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 DLSTP36957 453 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC26A3P40879 764 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 MSH2P43246 934 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 HNMTP50135 292 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SERPINB9P50453 376 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 PMS2P54278 862 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 MC1RQ01726 317 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SBSNQ6UWP8 590 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CNPY4Q8N129 248 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 MR1Q95460 341 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TLK1Q9UKI8 766 aa20.16■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 PCM1Q15154 2024 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZZEF1O43149 2961 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CDC7O00311 574 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CNTFP26441 200 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 TBPL1P62380 186 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 GRM7Q14831 915 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 MROH9Q5TGP6 573 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 LCTLQ6UWM7 567 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 C17orf64Q86WR6 236 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 DSELQ8IZU8 1212 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 EGFL8Q99944 293 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPR87Q9BY21 358 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 CROTQ9UKG9 612 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 ACOT9Q9Y305 439 aa20.15■□□□□ 0.82
ADAMTS17-205ENST00000558960 A0A087X1B8 175 aa20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 A0A0J9YVX5 310 aa20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 KRT38O76015 456 aa20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 ABHD2P08910 425 aa20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 CD63P08962 238 aa20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.14■□□□□ 0.81
ADAMTS17-205ENST00000558960 LGSNQ5TDP6 509 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms